Vienīgie planētas cilvēki, kuru senči nav krustojušies ar neandertāliešiem, ir Subsahāras Āfrikas iedzīvotāji. Jauni pētījumi parādīja, ka pat Melnā kontinenta ziemeļu daļas iedzīvotājiem ir neandertāliešu gēni.
Mūsu tuvāko evolūcijas radinieku genoma dekodēšana rāda, ka vidusmēra Eirāzijas DNS veido 1-4% no neandertāliešu ģenētiskā materiāla. Acīmredzot sekss starp abu sugu pārstāvjiem reti bija produktīvs, taču neatkarīgi no tā, cik daudz pēcnācēju bija, pietika ar svarīgu gēnu nodošanu saprātīgai personai, kas stiprināja viņa imunitāti.
Tā kā ir noskaidrots, ka cilvēkiem, kas tagad dzīvo ārpus Āfrikas, ir vairāk kopīga ar neandertāliešiem nekā afrikāņiem, ir loģiski uzskatīt, ka krustošanās notika ārpus Melnā kontinenta, kad pirmās Homo sapiens grupas sāka apmesties Tuvajos Austrumos (ne agrāk kā pēc 100 tūkstošiem gadu) atpakaļ).
Ir vēl viens, sarežģītāks viedoklis: neandertāliešiem un mūsdienu ne-afrikāņiem bija kopīgs sencis, kurš pirms aptuveni 230 tūkstošiem gadu atdalījās no mūsdienu afrikāņu senčiem. Otrais scenārijs ir teorētiski iespējams, taču jaunākie pētījumi ir atkārtoti apstiprinājuši pirmo hipotēzi. Arī šoreiz nebija jūtama: 780 000 ģenētisko variantu analīze no 125 cilvēkiem, kas pārstāvēja septiņas ziemeļāfrikāņu grupas, parādīja, ka šajās DNS ir daudz vairāk neandertāliešu DNS nekā Subsahāras afrikāņos.
Neandertāliešu gēnu līmenis šajās populācijās ir salīdzināms ar Eirāzijas līmeni. Zinātnieki arī ir noskaidrojuši, ka šis neandertāliešu ģenētiskais signāls ir augstāks tajās Ziemeļāfrikas populācijās, kuru senči bija salīdzinoši maz krustojušies ar mūsdienu Tuvo Austrumu un Eiropas iedzīvotājiem. Tas liek domāt, ka signāls nāk tieši no senās krustošanās ar neandertāliešiem, nevis no nesenajiem sakariem ar citiem cilvēkiem, kuru senči tika sajaukti ar citu sugu.
Tādējādi vienīgās mūsdienu cilvēces populācijas bez neandertāliešu piejaukuma ir grupas uz dienvidiem no Sahāras. Pēc pētnieku domām, iegūtie rezultāti nenozīmē, ka neandertālieši migrēja uz Āfriku un nonāca saskarē ar tur esošajiem vietējiem iedzīvotājiem.
Intīmā situācija, visticamāk, attīstījās Tuvajos Austrumos, no kurienes dažas grupas atgriezās atpakaļ Ziemeļāfrikā, asimilējot vai iznīcinot viņu senču populācijas. Turklāt pētījumā tiek norādīts, ka Ziemeļāfrikas iedzīvotāji nebija migrācijas avots uz Tuvajiem Austrumiem. Visticamāk, par pionieriem kļuva Austrumāfrikas iedzīvotāji. Ģenētiskās analīzes rezultāti ir publicēti žurnālā PLoS ONE.