Zinātnieki Brazīlijā ir atklājuši jaunu vīrusu, kura DNS ir 90 procenti no zinātnei nezināmiem gēniem. Atklājuma rezultāti tiek publicēti bioRxiv pirmsdrukas vietnē.
Vīruss tika atklāts mākslīgajā Pampulha ezerā Brazīlijas pilsētā Belo Horizonte. Tā ne pārāk sarežģītais genoms gandrīz pilnībā sastāv no zinātnei nezināmiem gēniem. Autori jauno vīrusu Yaravirus brasiliensis nosauca pēc ūdens nimfa Yara no Dienvidamerikas tautu mitoloģijas.
Zinātnieki spriež, ka viņi saskaras ar pirmo gadījumu, kad nezināma izolēta vīrusu grupa vai tāla suga ir milzu vīruss, kas ir attīstījies mazākā formā.
Atklāti tikai 21. gadsimtā, milzu vīrusu izmēri ir salīdzināmi ar baktēriju šūnas izmēriem. Viņi ieguva savu vārdu milzīgo kapsīdu - olbaltumvielu membrānu, kas iekapsulē virionus - dēļ vīrusu daļiņas. Viņiem ir arī atbilstoša garuma DNS, kas pārsniedz 200 tūkstošus bāzes pāru un bieži satur tā sauktos bāreņu jeb bāreņu gēnus (ORFan), kas nav sastopami nevienā citā organismu grupā.
Sarežģīti genomi ļauj milzu vīrusiem sintezēt olbaltumvielas un tāpēc veikt DNS remontu, replikāciju, transkripciju un tulkošanu. Pirms viņu atklāšanas tika uzskatīts, ka vīrusiem nav šādu spēju, jo tie ir inerti radījumi, kas var inficēt tikai viņu saimniekus. Visi zināmie milzu vīrusi ir amoebas parazīti.
Un, lai arī jaunā mikroorganisma lielums ir ievērojami mazāks nekā milzu vīrusiem - apmēram 80 nanometri -, tas arī parazitē uz amoebām, un tā genoms ir gandrīz pilnībā bārenis: 68 tā gēni (vairāk nekā 90 procenti) neatrod analogus nevienā zināmā organismā un tikai sešos neskaidri līdzīgi zinātnei zināmajiem.
"Tas notiek tāpēc, ka vīruss ir jauna amoebiskā vīrusa ciltslieta ar pārsteidzošu izcelsmi un filoģenēzi," paziņojumā presei sacīja viena no pētījuma vadītājām Jônatas Abrahão no Minas Gerais federālās universitātes Brazīlijā.
Zinātnieki ir analizējuši vairāk nekā astoņus ar pusi tūkstošus metagenomu, bet starp tiem nav atrasti vīrusi, kas saistīti ar jauno mikroorganismu. Tāpat kā citus šīs grupas vīrusus, to pārstāv divpavedienu DNS, kuras garums ir 44 900 bāzes pāri un satur 74 kodējošus fragmentus.
Reklāmas video:
“Izmantojot standarta protokolus, mūsu pirmajā ģenētiskajā analīzē neizdevās atklāt nevienu atpazīstamu kapsīda secību vai citus klasiskus vīrusu gēnus jaavirusā,” skaidro Yonatas Abrajao un otrā pētījuma vadītājs Bernards La Scola no Aiksas-Marseļas universitātes Francija.
Saskaņā ar oficiālajiem metagenomiskajiem protokoliem, yaravirus pat nevar atzīt par vīrusu ierosinātāju, jo tam nav skaidras līdzības ar tiem. Zinātnieki vēl nevar pateikt, kas viņš patiesībā ir - pilnīgi jaunas grupas pārstāvis vai milzu vīrusa pēcnācējs, kurš kaut kā attīstījās mazākā formā.
"Nezināmu olbaltumvielu skaits, kas veido yaravirus daļiņas, atspoguļo mainīgumu, kas pastāv vīrusu pasaulē, un to, cik daudz jaunu vīrusu genomu vēl nav atklāti," secina autori.