Zinātnieki cūku genomā ir atklājuši unikālu īsu atkārtojumu ģimeni, kam ir evolūcijas līdzība ar līdzīgiem primātu atkārtojumiem.
Sadarbībā ar Firefly BioWorks Corporation (ASV) projektā piedalījās zinātnieki no Dzilinas universitātes (Čangčūna, Ķīna) un Lauksaimniecības zinātņu akadēmijas (Heilongdzjana, Ķīna).
Izanalizējuši PRE-1 struktūru un izcelsmi (cūku atkārtošanās elements, burtiski - "cūku atkārtojošais elements"), viņi nonāca pie secinājuma, ka tuvākie primātu radinieki bijušajā superkontinentālajā Laurāzijā varētu būt cūkas. Pētījuma priekšdruka tika publicēta bioRxiv serverī 2015. gada 31. augustā.
Pētītais CDP (īss disperģēts atkārtojums) PRE-1 atrodas starpgēnu reģionā, aptuveni 686 ~ 985 bāzes pāri pirms insulīna augšanas faktoru saistošā proteīna (IGFBP7) kodējošā gēna sākuma. Atkārtotā 299 bāzes pāru PRE-1 secība tika salīdzināta ar 40 dažādiem primātu Alu atkārtojumiem, un tika konstatētas būtiskas līdzības gan pašās secībās, gan to atkārtošanās sadalījuma pa hromosomām modelī.
Paredzētā RNS sekundārā struktūra atkārto PRE-1, kas salocīts modelī, kas līdzīgs Alu atkārtojumiem. Visbeidzot, PRE-1 un Alu kopīgā izcelsme no tā sauktās 7SL RNS (signāla atpazīšanas RNS) ieteica to evolūcijas līdzību un cūkas attiecināja uz ģimeni, kurā galvenokārt ietilpst primāti.
Iepriekš, veidojot filoģenētiskus kokus, zinātnieki paļāvās tikai uz gēnu līdzībām un atšķirībām, neņemot vērā faktu, ka evolūcijas laikā mainījās viss genoms, ieskaitot tā elementus, kas nekodē olbaltumvielas vai RNS, un kuru nozīme zinātniekiem joprojām ir lielā mērā neskaidra.
Reklāmas video:
Šis pētījums, kas balstīts uz integrētu pieeju starpģēnu elementu analīzei, pēc autoru domām sniedz "ļoti pārliecinošus" faktus, no kuriem var izdarīt evolūcijas secinājumus. Saskaņā ar šiem rezultātiem paredzamais sugu atšķirību laiks no 65 līdz 80-100 miljoniem gadu mainās.